V typickej syntéze DNA, RNA a prirodzene sa nevyskytujúcich nukleových kyselín hrá rozhodujúcu úlohu krok deprotekcie a párovania.
Krok odstránenia chrániacej skupiny je odstránenie DMT skupiny na pevnom nosiči alebo 5' hydroxylovej skupiny na predchádzajúcom nukleozide pomocou organickej kyseliny a vystavenie hydroxylovej skupiny pre nasledujúci kopulačný krok.Na uskutočnenie deprotekčného kroku sa väčšinou používa 3% kyselina trichlóroctová v dichlórmetáne alebo toluéne.Koncentrácia kyseliny trichlóroctovej a čas odstránenia ochrannej skupiny (čas odblokovania) dominujú čistote konečných produktov.Nízka koncentrácia a nedostatočný čas odblokovania ponecháva nezreagovanú skupinu DMT, čo znižuje výťažok a zvyšuje nežiaduce nečistoty.Dlhý čas odblokovania môže viesť k depurínu syntetizovaných sekvencií, čím sa vytvoria neočakávané nečistoty.
Krok spájania je citlivý na obsah vody v rozpúšťadlách a vlhkosť vo vzduchu.Koncentrácia vody v syntéze by mala byť menšia ako 40 ppm, lepšie menšia ako 25 ppm.Aby sa zachoval stav bezvodej syntézy, syntéza nukleových kyselín by sa mala vykonávať v prostredí s nízkou vlhkosťou, preto našim zákazníkom odporúčame použiťZariadenie na rozpustené amidity, ktorý môže rozpustiť práškový alebo olejový fosforamidit v bezvodom acetonitrile, aby sa zabránilo kontaktu so vzduchom.
Pretože rozpúšťanie fosforamiditov je lepšie v situácii bez vody, a molekulárne pasce na adsorbovanie stopovej vody v činidlách a amidite, je potrebné pripraviťMolekulárne pasce.Odporúčame 2 g subsiete pre 50-250 ml reagenčné fľaše, 5 g pre 250-500 ml reagenčné fľaše, 10 g pre 500-1000 ml reagenčné fľaše a 20 g pre 1000-2000 ml reagenčné fľaše.
Rozpustenie fosforamiditov by sa malo uskutočňovať v inertnej atmosfére a výmena aktivačných činidiel a acetonitrilu by mala byť ukončená včas.Uzavieracie a oxidačné činidlá by sa mali použiť čo najskôr, otvorené činidlá majú menšiu skladovateľnosť a nižšiu aktivitu počas syntézy.
Čas odoslania: august-09-2022